The OpenNET Project / Index page

[ новости /+++ | форум | теги | ]

Indigo: пакет open-source программ для органической химии

29.10.2009 02:51

Состоялся первый публичный релиз пакета программ для органической химии под названием Indigo. Пакет состоит из пяти частей:

  • Bingo: картридж (плагин) к СУБД Oracle с реализацией различных видов «химического» поиска молекул и реакций.
  • Dingo: библиотека для рендеринга молекул и реакций, с обёрткой на C# и command-line утилитой.
  • Cano: библиотека для подсчёта canonical SMILES — уникального представления молекулы, с обёрткой на C#.
  • Deco: библиотека и command-line утилита для разложения набора молекул на общую часть и заместители (R-Group deconvolution)
  • Nucleo: библиотека для работы с нуклеотидными цепочками, с обёрткой на Java.

Все программы реализованы на C++. Поддерживаемые платформы - Windows, Linux, Mac OS X, Solaris на SPARC. Исходные тексты распространяются под лицензией GPL v3.

  1. Главная ссылка к новости (http://opensource.scitouch.net...)
Автор новости: Dmitry Pavlov
Лицензия: CC BY 3.0
Короткая ссылка: https://opennet.ru/24031-soft
Ключевые слова: soft
При перепечатке указание ссылки на opennet.ru обязательно


Обсуждение (17) Ajax | 1 уровень | Линейный | +/- | Раскрыть всё | RSS
  • 1.1, Zenitur (?), 12:17, 29/10/2009 [ответить] [﹢﹢﹢] [ · · · ]  
  • +/
    Жду когда включат в основной состав дистрибутивов.
     
     
  • 2.2, abra (ok), 12:40, 29/10/2009 [^] [^^] [^^^] [ответить]  
  • +/
    Какой химией занимаемся?
     
     
  • 3.3, BirdGovorun (??), 13:55, 29/10/2009 [^] [^^] [^^^] [ответить]  
  • +/
    Наверное этой
    C21H23NO5
    или этой
    C7H5N3O6
     
  • 2.15, От автора (?), 11:52, 30/10/2009 [^] [^^] [^^^] [ответить]  
  • +/
    Это станет возможным, когда появятся пользователи.
     

  • 1.4, аноним (?), 15:48, 29/10/2009 [ответить] [﹢﹢﹢] [ · · · ]  
  • +/
    Господи, oracle, c# и java. Ничего себе коктейль, работать только в закрытом помещении - слетаются сотни мух. Правда, люди от вони дохнут.
     
     
  • 2.5, Warhead Wardick (?), 17:20, 29/10/2009 [^] [^^] [^^^] [ответить]  
  • +/
    Проект открытый - перепиши на чем кошерном вместо того чтобы тут <beeeeep>
     
     
  • 3.7, Аноним (-), 20:56, 29/10/2009 [^] [^^] [^^^] [ответить]  
  • +/
    пусть авторы переписывают
     
     
  • 4.9, От автора (?), 21:07, 29/10/2009 [^] [^^] [^^^] [ответить]  
  • +/
    Будьте конструктивнее, пожалуйста. Прекратите истерику и скажите, что бы вы советовали нам переписать и как именно.
     
     
  • 5.12, аноним (?), 04:26, 30/10/2009 [^] [^^] [^^^] [ответить]  
  • +/
    Где вы увидели истерику? Выкиньте все обертки для недоязыков, потому что java - это тормоза и память в помойку, а mono - то же самое + патенты. Кроме того, плагин перепишите под postgres, а oracle - нигде не используемая проприетарная недоБД.
     
     
  • 6.14, От автора (?), 11:29, 30/10/2009 [^] [^^] [^^^] [ответить]  
  • +/
    Совет выкинуть обёртки -- это неконструктивно, извините. Обёртки были сделаны для того, чтобы использовать наши компоненты в конкретных проектах, написанных на C# и Java. Очевидно, люди из-за нас не стали бы переписывать их на чём-либо ещё.

    Что касается Oracle: вы будете удивлены, но она используется во многих фармацевтических компаниях, а postgres в них не очень известен. Однако, порт на postgres в принципе возможен.

     
     
  • 7.16, Serg (??), 17:48, 30/10/2009 [^] [^^] [^^^] [ответить]  
  • +/
    > Совет выкинуть обёртки -- это неконструктивно, извините. Обёртки были сделаны для того, чтобы использовать наши компоненты в конкретных проектах, написанных на C# и Java.

    Мне кажется выкидывать обертки, если они уже есть, смысла нет, но главное - чтобы инструментами можно было пользоваться не прибегая к java/mono вообще. Нативному коду всегда надо отдавать предпочтение.

    А про oracle не соглашусь - я как раз postgres видел много где. Часто именно с oracle на него переходят.

     
     
  • 8.17, от автора (?), 18:27, 30/10/2009 [^] [^^] [^^^] [ответить]  
  • +/
    Конечно Взгляните на страницу Downloads на сайте -- для всех библиотек есть C... текст свёрнут, показать
     

  • 1.8, От автора (?), 21:07, 29/10/2009 [ответить] [﹢﹢﹢] [ · · · ]  
  • –1 +/
    Будьте конструктивнее, пожалуйста. Прекратите истерику и скажите, что бы вы советовали нам переписать и как именно.
     
  • 1.10, Необъективный_ (?), 23:10, 29/10/2009 [ответить] [﹢﹢﹢] [ · · · ]  
  • +1 +/
    Было бы неплохо добавить "обёртку" на Qt, GTK+ или wxWidgets. Пакету светлого будущего, авторам успехов.
     
     
  • 2.11, От автора (?), 23:26, 29/10/2009 [^] [^^] [^^^] [ответить]  
  • +/
    Спасибо. Обёртки, действительно, ожидаются в недалёком будущем.
     
     
  • 3.13, аноним (?), 04:27, 30/10/2009 [^] [^^] [^^^] [ответить]  
  • +/
    >Спасибо. Обёртки, действительно, ожидаются в недалёком будущем.

    Вот-вот, люди правильно говорят. Qt было бы идеальным.

     
     
  • 4.18, аноним (?), 18:40, 30/10/2009 [^] [^^] [^^^] [ответить]  
  • +/
    >>Спасибо. Обёртки, действительно, ожидаются в недалёком будущем.
    >
    >Вот-вот, люди правильно говорят. Qt было бы идеальным.

    Уважаемый, внесите ясность пожалуйста. Для чего обертки были бы идеальными и зачем они вообще здесь?


     
     
  • 5.19, Аноним (-), 22:32, 30/10/2009 [^] [^^] [^^^] [ответить]  
  • +/
    По-моему, все понятно - народ хочет работать без использования тормозных, неэффективных и опасных технологий, как-то java, mono и oracle. Библиотеки, как понятно из новости, и так на C++, а хочется чтобы и front-end'ы были нативные и открытые.
     

     Добавить комментарий
    Имя:
    E-Mail:
    Текст:



    Партнёры:
    PostgresPro
    Inferno Solutions
    Hosting by Hoster.ru
    Хостинг:

    Закладки на сайте
    Проследить за страницей
    Created 1996-2024 by Maxim Chirkov
    Добавить, Поддержать, Вебмастеру