Чтобы не быть голословным решил сделать небольшой тест, результат, прямо скажу - неожиданный!
Небольшой скрипт, буквально на коленке

#! /usr/bin/perl -w

use strict;
use Time::HiRes        qw(gettimeofday);
use Fcntl        qw(O_WRONLY O_CREAT O_TRUNC);

my $data    = (0)x1024;
my $len        = length($data);
my $count    = 0;

my($sec,$usec)    = gettimeofday();
my $time    = $sec * 1_000_000 + $usec;

for(0..1_000_000){

  my $name = sprintf('dir/%06d',$count);
  if(sysopen(*FO,$name,O_WRONLY|O_CREAT|O_TRUNC)){
    syswrite(*FO,$data,$len);
    close(*FO);
  }
  $count++;
}

($sec,$usec)    = gettimeofday();
$time        = $sec * 1_000_000 + $usec - $time;

printf("%8d\n",$time);

Накропал, запустил на своей машине, старой, но хорошей, атлон восьмиядерник, 32гб, дебиан, отрабатывает около 20 сек.

Потом попробовал запустить на винде (ноут, 8.1, core i5-4200, 4гб)
Прямо скажу - ТАКОГО я не ждал!
1941709001 !!!
1941 секунда с копейками...
Уж думал что зациклилось как-то - нет, диспетчер показывает 100% диска...
Еле дождался
Для ста тысяч - 106758046, зависимость не линейная.

Реально в ах*е, проверяю на той же машине в виртуалке (виртуалбокс, дебиан, выделил 1гб)- 81145834
В 20 РАЗ меньше!

В линуксе (виртуальном) заходит в каталог с ощутимой на глаз задержкой
В винде проводник рисует зеленую полоску секунд 30-40

Вощем полагаю - проблемы с виндами в основном вызваны не кривизной рук, а софта.