> Это да, но также она гарантирует и то, что данные считанные с диска - это те же данные, что на него и записывались.

Не гарантирует. Кроме чтения с физического носителя есть ещё firmware котроллера самого диска, а там внутри кэш который навряд ли в лоу энде чем-то вообще защищён. И само firmware тоже нередко бывает с ошибками. HDD это уже давно не просто набор блинов. Ещё раз попробую донести смысл суммы на диске - это часть механизма общения между физ. носителем и firmware диска, и всё.

> Тут же, усиленно предлагают, и за это неистово "плюсуют", ввести второй уровень проверки корректности данных

нет тут второго уровня, это ваша фантазия и какое-то непонимание что, как и где нужно.

> Единственное, для чего это может пригодиться, так это для аудита системы и проверки того, что никто не изменил данные извне.

Аудит это совсем другая область и она не имеет отношения к суммам на уровне ФС. Суммы для аудита реализуются совсем другими методами с точки зрения реализации, у них разные временные характеристики и т.п.

> Мной предлагался способ считать контрольные суммы без участия ФС, что я считаю как минимум более логичным.

если вам нужно просто считать суммы непонятно для какой цели и для чего, то да, их можно считать без ФС и даже без участия каких-либо полезных данных. Тупо можно взять /dev/urandom, посчитать сумму и считать это более логичным чем суммы в ФС