> Gentoo ONLY ибо:
> 1) В бинарных дистрах пакеты собраны с поддержкой всякой хрени. Например CUPS
> ... в нем есть поддержка PHP. В данном случае она мне
> не нужна а библиотека в системе будет.

Зачем на хост-машине всякая хрень типа cups и php?
Хост-машина должна ставиться в минимальной конфигурации с минимально-требуемым кол-вом пакетов. А вот в гостевых системах можно ставить уже что угодно и на какой-угодно ОС.

> 2) При установке сторонних программ и/или обновлении одной какой-то конкретной библиотеки
> потребуется ставить сырцы и накладывать патчи для корректной работы.

Для RHEL, Centos, Oracle Linux выходят апдейты. При выходе нового апдейта, подключаем репозиторий, а дальше yum update сделает своё дело. И никаких сырцов и компиляций. А также забудьте про сторонние программы в хост-системе.

> 3)
> а. RHEL-платная.
> б. CentOS - ядро модульное (в прочем как у большинства) а пересобирать
> ... опять же на Gentoo привычнее.
> в. Linux от Oracle в глаза не видел. Да и не слашал,
> если честно.

Centos - свободная и бесплатная копия RHEL. Совместимы бинарно.
Oracle Enterprise Linux - фактически копия RHEL, со своими оптимизациями. Бинарно совместимы.

А насчёт пересборки ядра - нафига оно надо? Тем более на хост-машине... Вы же не кодер-разработчик драйверов под новейшее и экзотическое железо... Раньше, по молодости тоже этим баловался. Но реально такой необходимости НЕТ.