Совет на будущее. Если используешь rpm дистр, то ставь все только из rpm, тогда проблем в будущем будет на порядок меньше.

Установка очень простая, скачиваешь пакет, например  zlib-1.2.3-3.i686.rpm. И затем устанавливаешь его с помощью команды
# rpm -ivh zlib-1.2.3-3.i686.rpm

Если надо обновить пакет, а это очень часто надо выполнять, то
# rpm -Uvh zlib-1.2.3-3.i686.rpm

Удалить пакет (деинсталировать программу в windows)
# rpm -e zlib-1.2.3-3

А чтобы узнать куда и какие файлы установились можно сделать так
# rpm -ql zlib
/usr/lib/libz.so.1
/usr/lib/libz.so.1.2.3
/usr/share/doc/zlib-1.2.3
/usr/share/doc/zlib-1.2.3/ChangeLog
/usr/share/doc/zlib-1.2.3/README
/usr/share/doc/zlib-1.2.3/algorithm.txt

Или если ты хочешь узнать, к какому пакету принадлежит определенный файл, то
# rpm -qf /usr/sbin/squid
squid-2.5.STABLE9-10

Список всех пакетов установленных в системе
# rpm -qa

или например список всех установленных пакетов, в названии которых встречается определенное слово
# rpm -qa | grep squid
squidGuard-1.2.0-5
squid-2.5.STABLE9-10

И много чего еще. Короче man rpm тебе поможет.

Если ты будешь ставить все с помощью ./configure make && make install. Все эти удобства тебе будут не доступны.

Тебе уже правильно говорили, что линух от линуху тоже отличается. Так например в SuSe своя система пакетов, и эти пакеты (rpm) уже не подойдут. В Debian еще одна система пакетов. У каждой есть свои удобства и не достатки.

Я например все пакеты собираю под VMware и ставлю готовые rpm на сервер. Очень удобно. Единственное что я не смог найти в rpm, так это netams (программа для учета трафика). Я ее собрал под VMware, скопировал бинарники и файлы настроек и запаковал. Потом распаковал на сервере и положил в нужные папки. Хорошо что там файлов немного.