>Я бы хотел посмотреть что он отдает, а именно записи касающиеся сервисов AD2.

Вывод dig:

; <<>> DiG 9.10.1 <<>> mydomain.ru any
;; global options: +cmd
;; Got answer:
;; ->>HEADER<<- opcode: QUERY, status: NOERROR, id: 34954
;; flags: qr aa rd ra; QUERY: 1, ANSWER: 8, AUTHORITY: 0, ADDITIONAL: 5

;; OPT PSEUDOSECTION:
; EDNS: version: 0, flags:; udp: 1280
;; QUESTION SECTION:
;mydomain.ru.                IN    ANY

;; ANSWER SECTION:
mydomain.ru.            600    IN    A    192.168.1.3
mydomain.ru.            600    IN    A    192.168.1.2
mydomain.ru.            3600    IN    NS    ad4.mydomain.ru.
mydomain.ru.            3600    IN    NS    ad1.mydomain.ru.
mydomain.ru.            3600    IN    NS    ad2.mydomain.ru.
mydomain.ru.            3600    IN    SOA    ad2.mydomain.ru. . 45531 900 600 86400 3600
mydomain.ru.            3600    IN    MX    10 mail.mydomain.ru.
mydomain.ru.            0    IN    TYPE65281 \# 20 00000000000000020000038400000001C0A86407

;; ADDITIONAL SECTION:
ad4.mydomain.ru.        3600    IN    A    192.168.1.9
ad1.mydomain.ru.        3600    IN    A    192.168.1.2
ad2.mydomain.ru.        3600    IN    A    192.168.1.3
mail.mydomain.ru.        3600    IN    A    192.168.1.22

;; Query time: 0 msec
;; SERVER: 192.168.1.3#53(192.168.1.3)
;; WHEN: чт июн 22 10:34:46 MSK 2017
;; MSG SIZE  rcvd: 273

PS:
ad4 - это новый контроллер домена, 2012-й, на который я буду переползать. Там только DNS, в AD пока не вводил.
Если ещё что-то вывести - скажи что именно.

> Я думаю через какой контроллер ты вводил в домен, к тому самба
> и привязана. Введёшь через вторичный, будет всё наоборот - с ним
> будет работать а с первичным нет.

Класс... и на кой тогда вообще резервные контроллеры домена и AD... Только для Винды?
Вообще, я обычно ввожу не через контроллер, а из строки самого сервера с самбой, что-то вроде этого:
net ads join -U administrator -D DOMAIN_NAME
А вот как это делал автор этого сервера - не знаю...
Не, я не против, просто знать бы - где эта привязка?