> Простите, я шляпой практически не пользовался, все как-то больше на gentoo

Бог простит. В принципе для бинарных дистров разницы нет, там компиляция пакета операция не предназначенная для регулярного использования кроме случаев когда по своим причинам вы поднимаете свой репозиторий и ментейните свою сборку пакета.

> Подскажите плз, вам это приходится делать каждый раз при обновлении пакета, или
> достаточно один раз при установке системы указать, что этот пакет будет
> отличаться от того что в репах ВОТ-ЭТИМ-КЛЮЧЕМ?

Вопрос некорректен. Гентушники забывают, что gentoo это мета-дистр.
Из одинаковых сырцов система у вас и у меня будет разная.
Для бинарного дистра использование пакета отличного от того, что в репах значит, что это другой пакет.

>[оверквотинг удален]
> версия с актуальной зависимостью), можно даже установить этот пакет из сорцов
> по приведенному вами выше принципу.
> Ну а можно выполнить
> emerge -avt1 @preserved-rebuild
> и получить желаемое - обновление пакетов с битыми зависимостями. Кстати, в случае
> бинарного обновления пакетов из своего PORTAGE_BINHOST(или  предоставляемого сообществом,
> к примеру как в кальке), само собой, пакеты с измененными USE-флагами
> будут компилироваться а не качаться. И даже если вас новая версия
> чем-то не устроит, всегда можно замаскировать обновление именно этого пакета, но
> не поломать зависимости обновляемых утилит от новой версии либы(тот самый @preserved-rebuild).

Фактически это параметры генерации пользовательского дистра, stage4 типа.
Это все удобно, но это генерация своего дистра под себя любимого.
Это никак не управление пакетами.

>> Я просто хочу понять, в чем эти преимущества заключаются, если они есть на самом деле.
> Постарался разъяснить. Убедил?

Вряд ли. В бинарный монастырь не стоит идти с гентушными правилами, как и наоборот.