> Проблема в том, что раньше он получал зарплату в Ремблере и пилил
> nginx в своё удовольствие.

Скорее, в удовольствие Rambler'а. Или в обоюдное :-)
Впрочем, им сейчас не до nginx. Им сейчас надо модернизационно-инновационный перевод почты на Linux совершить. А тут какой-то там веб-сервер.

>Сейчас он уже формально не владеет кодом

Из чего это следует? Где пруфы?

> и является тем же работником по найму, но теперь акционеры и
> инвесторы будут определять будущее, а не он.

Акционерами там пока и не пахнет. Акционеры появятся только после IPO или после продажи компании какому-нибудь другому ОАО или ЗАО.
Власть инвесторов тоже не стоит преувеличивать. Насколько я понимаю культуру стартапов и отношения "предприниматель - инвестор" в Кремниевой Долине, там обычно делается несколько иначе: предприниматель выносит на свет бизнес-план, инвесторы его рассматривают и дают денег, если считают, что этот план выстрелит. Будущее по-прежнему определяет предприниматель, вот только ему теперь надо считаться с тем бизнес-планом, под который ему дали денег. Разумеется, деталей соглашения с инвесторами я не знаю, однако, очень сильно сомневаюсь, что он закабалил себя и передал права на код. Трех миллионов вечнозеленых маловато для того, чтобы купить такой продукт, как nginx, и такого разработчика, как Сысоев.

>Из владельца он превратился
> в рядового подневольного работники, пусть и с регалиями CTO.

Еще раз - в подневольного он превратится тогда, когда его компанию продадут, или она проведет IPO.

>Контроль из
> своих рук он выпустил, к чему всё это приведет не ясно.

Ничего он из своих рук не выпустил. Для него все только начинается. Эти деньги в числе прочего пойдут на открытие офисов в Америке. Что свидетельствует о том, что его компания только-только планирует развернуться.