><Directory /usr/home/ftp/uploads>
>
><Limit READ WRITE>
>AllowAll
></Limit>
>
></Directory>

WRITE - как помню, это больше, чем просто запись, т.е. совокупность команд, которые провоцируют некие изменения. Так что используйте для _только_ записи что-то типа такого:

<Limit MKD STOR>
AllowAll
</Limit>

ну а чтение уже по вкусу

а почему у вас аплоад не работает - не знаю, давно не пользовался proftpd, да и память плохая, но попробуйте хотя бы вот такой вот "детский" кусочек:

<Anonymous ~ftp>

User            ftp
Group            ftp

AnonRequirePassword    off
RequireValidShell    off

UserAlias         anonymous ftp

<Directory *>

    DirFakeMode    0440
    DirFakeUser    on ftp
    DirFakeGroup    on ftp

    <Limit WRITE>
    DenyAll
    </Limit>

</Directory>

<Directory incoming>

    DirFakeMode    0640
    
    <Limit STOR MKD>
    AllowUser    ftp
    </Limit>

</Directory>

</Anonymous>