Какой линукс? Линукс ли?

> Всем привет. Хочу поставить сервер, который будет выступать в роли фильтров между
> клиентом и сервером.
> Сервер фильтрации должен менять адрес назначения на адрес сервера и в обратном
> порядке.

A?
Постарайтесь нарисовать топологию, или придумайте им всем внятные имена и адреса чтобы описать словами.
Кто с кем в одной сети, а кто в Интернете?
Кто чей default gateway?

> Но когда я пытаюсь послать пакет на сервер фильтрации, он приходит, переходит
> в цепочку FORWARD и дропается самой сетевой картой. Соответственно пакет сервер
> не принимает.

Вы хотите слать пакеты UDP с клиента на фильтры, но чтобы потом он попадал на сервер с адресом отправителя клиента?
Рекомендую сделать шаг назад и сформулировать, чего вы, собственно, стремитесь достичь.

> НО, если я поменяю адрес источника клиента на адрес сервера фильтров, то
> пакет будет передан серверу, но не с IP клиента, а с
> IP фильтров. А мне нужен, чтобы пересылался IP адрес клиента.
> Помогите, пожалуйста, с решением вопроса!

Чем смотрите, сниффером на сервере?