Ок, проблема понятна. Да, неприятная особенность SQLite. Только это не проблема эффективности хранения и отсутствия схемы, а проблема отсутствия ограничений по типу. Хранение тут более-менее эффетивное, но не самое оптимальное. LE или BE для СУБД вообще никакого значения не имеет, считай это особенностью кодирования. СУБД может хранить числа как угодно, хоть всё в VARINT-ах или поколоночном delta кодировании на битах. LE или BE имеет значение толлко когда есть возможность работать с данными прямо из хранилища, SQL СУБД такой фичей не обладают.