После выполнения этой команды в debian stretch все gem'ы перестали работать. Пришлось всё касающееся ruby с нуля переставлять.

Симптомы: gem'ы лежат в /var/lib, а после этой команды приложения ruby стали искать их в /usr/share. Хотя новые gem'ы ставятся, по-прежнему, в /var/lib.