>Самое очевидное, промах при клике в меню не приведет к закрытию приложения

у вас трясутся ручки, что вы мажете по меню? П.с. в некоторых программах меню может располагаться вдоль всей длины экрана, т.е. и с правой стороны (из этого вообще есть выход -- делать неактивным кнопку закрытия окна или все три кнопки управления окном, когда ты находишься в меню программы). В общем не аргумент.
Ещё один довод к расположению управлением окнами слева....при просмотре множества скриншотов заметил, что те, кто используют док, используют его с левой стороны (использовать док сверху или снизу на широкоформатных экранах могут только любители смотреть в танковую щель). Так вот, при использовании дока с левой стороны, использовать кнопки управления окном удобнее слева, т.к. после того, как курсор был с левой стороны экрана, его не нужно будет елозить через весь экран вправо.