вы хотите сделать что-то вроде :
----------
char name[PATH_MAX];
FILE *f;
f=popen("find / -name....","r");
while (! feof(f)) {
  if (fgets(name,PATH_MAX,f)==NULL) continue;
  chmod(...);
}
---------
find / -type f -name \*.html -exec chmod ugo-x {} \;