Вот как я делал - генерированный через Xorg -configure xorg.conf (http://pastebin.com/YkwQQ6Vt) c добавленным параметром

Section "ServerFlags"
    Option    "AutoAddGPU"     "false"

В него вписал все используемые первым рабочим местом устройства -

видеокарта
lspci | grep VGA
00:0d.0 VGA compatible controller: NVIDIA Corporation C61 [GeForce 6150SE nForce 430] (rev a2)

- соответствует параметру
BusID       "PCI:0:13:0" и использует nouveau

мышь и клавиатура - автоматически цепляется любая, подключенная к компьютеру, кроме прописанных во втором конфигурационном файле (xorg.config)

Второй конфигурационный файл xorg.config (http://pastebin.com/MWKmR0Br) сгенерированный через nvidia-xconfig c добавлением

Section "ServerFlags"
        Option "AutoAddDevices" "false" # все подключаемые устройства будут работать только на другом месте
        Option "AllowEmptyInput" "false" # точно не помню для чего
        Option  "AutoAddGPU"     "false"

видеокарта
lspci | grep VGA
02:00.0 VGA compatible controller: NVIDIA Corporation GF108 [GeForce GT 440] (rev a1)

- соответствует параметру
BusID          "PCI:2:0:0" и использует проприетарный драйвер.

устройства мыши и клавиатуры вычислил через
cat /dev/input/*

и параметр
Option         "GrabDevice" "on"
не пускает эти устройства на первое рабочее место.

В lightdm.conf прописал 2 рабочих места
Seats=Seat:0 Seat:1
[Seat:0]
xserver-command=/usr/bin/X -nolisten tcp  vt7 :0
# использует стандартный xorg.conf
[Seat:1]
xserver-command=/usr/bin/X -config /etc/X11/xorg.config -nolisten tcp -novtswitch -sharevts vt8 :1
# использует xorg.config  и не реагирует на переключение в vt1-6

Прошу прощения за длинный текст, вышеописанное - компиляция поиска по форумам/мануалам, точных ссылок на которые дать не смогу.

Альтернативный способ настройки есть тут -
http://www.linux.org.ru/wiki/en/User:aol/Multiseat_Ubuntu

Звук настраивал так, как написано по ссылке.