Ну окошко настройки давольно сложное, но сколько себя помню все работало на отлично.

Там все сгруппировано по видеокартам/типам вывода/мониторам. Если не знаешь что куда точно подключено, можна нажать кнопочку подписать мониторы (как то так она называется). На каждом мониторе появляется надпись где показано где какой монитор. Дальше просто указываем где какой монитор расположен, относительно другого.

Окно конфигурации может Вам сложное потому как есть возможность в разных комбинациях, например, сгруппировать изображение, например два монитора показывают идентичную картинку (да одим может даже и в масштабе), третий стоит справа от этого изображения. Обычно конфигурялки попроще и не позволяют группировать изображение, поэтому народ и путается, но разобратся во всем не сложно. После всего нажимаем применить, чтобы посмотреть правильно ли настроили. И вот тут опять таки может быть сложность для тех кто не разобрался. Все варианты конфигураций можно отдельно согранять, а потом клац и переключился на другой профиль. По этому очень важно указать какая конфигурация используется по умолчанию. Если используете более двух мониторов, да еще и часто что-то подключаете/отключаете ощютили бы всю мощь кед работы с мониторами.

Понятно, что кеды должны быть собраны с флагом xinerama. Дальше под каждый монитор можно свой набор плазмоедов панелек настроить, задачки показывать на панели, например только с текущего экрана.

Похоже эта система на какое-то "наса" ориентирована :) Где на сотни мониторов нужно что-то выводить :)