По опыту, как раз многие любители Windows Explorer и хранят файло в виде помойки, они редко что-либо рассовывают по папкам, у них обычно десяток гиг лежит прямо на рабочем столе, половина папок называются "1", "111", "Новая папка" и т.д., файлы с веба (xcvhrgoa2193847925_1239746_бла-бла-бла-еще-100-букаф.zip) лежат тут же, и они вечно не могут ничего найти. Зато интуитивно понятный интерфейс, фигли. Т.е., я думаю, вы путаете причину и следствие. Explorer-style-файлменеджеры нисколько не способствуют умению удобно ворочать своими файлами, поскольку представляют каталоги в перемешанном виде и захламляют большую часть экрана огромными иконками, рядом с которыми часто не умещается полное название файла, не говоря уже о всякой полезной инфе. Да, это все конфигурится, но пользователь первым делом использует то, что видит, и в итоге привыкает к этому, поскольку не знает ничего другого.