:) Хех.
Ну, раз уж такие дела...
Конечно, _можно_ класть имя сервера (заметьте, одно!) в Subject в виде
dc=host,dc=domain,dc=tld
Но, повторюсь, _одно_. Остальное - всё туда же, в расширение.

НО! Где ГОСТ, там и закон! :) А закон гласит о поэкземплярном, персонифицированном учёте.
А персонификацию, всё-таки, удобно проводить по Subject.
Т.о. считаю, что лучше сразу заносить DNS в расширение.
Вот :)