Извините, 60 кадров в секунду для скринкаста слишком много. Хватает 5 кадров в секунду, будет некоторая латентность, зато размер позволяет его смотреть практически на любом канале, а не качать сначала. И размеры захватываемой области тоже лучше седлать поменьше.
Я понимаю, что это рефренсная команда, просто народ обычно методом copy-paste работает, просто потом становится мучительно больно, когда понимаешь, что остается только переснимать. Я бы захватывал так:
#ffmpeg -r 5 -g 120 -s 640x480 -f x11grab -i :0.0 -vcodec qtrle screencast.mov
(обычно скринкасты ужимают до 320х480, но это как кому нравится, и ключевой кадр каждые 2 секунды, тогад навигация в редакторах проще), а после редактирования и финального мастеринга - конвертация в flv.