mysql-5.0.67
./configure --prefix=/usr/local/mysql
#cp support-files/my-medium.cnf /etc/my.cnf
далее по ману
#cd /usr/local/mysql
#bin/mysql_install_db --user=mysql
#chown -R root  .
#chown -R mysql var
#chgrp -R mysql .
#/usr/local/mysql/bin/mysqld_safe &
#/usr/local/mysql/bin/mysql -u root

mysql> use mysql;
mysql> set password for 'root'@'localhost' = password('passwd');
mysql> flush privileges;
mysql> \q

Потом что то случилось
смотрю mysql лежит
в /var/bd /нет папки мускула с логами
в /var/run/ нет mysql.pid
в /var/ не создается mysql.sock

gentoo-openvz-~amd64-2008-11-27 ~ # /usr/local/mysql/bin/mysql start

выдает такое

ERROR 2002 (HY000): Can't connect to local MySQL server through socket '/tmp/mysql.sock' (2)

Напишите что где можно проверить, дописать, подправить что б заработало