var/cache/PackageKit
var/cache/dnf
var/cache/akmods
var/cache/swcatalog/cache
var/lib/flatpak/appstream
var/lib/systemd/coredump

/var/cache я вообще грохнул, ничего не изменилось кроме десятков гигабайт свободного места, все работает и запускается. var/lib/flatpak/appstream тоже гигабайт 10 занимал, грохнул и его, ничего не изменилось, все работает и запускается, обновляется...

var/log/journal грохнул давно, он еще и понимает твои намерения и отключает после этого лог.