Ни у кого не было проблем с флэшками (ну немного жестковатые ограничения на самом деле), проблемы были с рекламой через которую распространяли малварь. Вместо флэша это ровно та же могла быть жава или activex или просто исполняемый код, потом конечно догадались что запускать недоверенный код можно только после подтверждения пользователя. Сегодня вот у всех из бэкдоров стоит только openh264, а тогда был выбор. И у пользователя больше никто не спрашивает кстати.