0) сложно сказать - я сисадмин, а не разработчик oVirt. Исходный код доступен https://github.com/oVirt думаю если его изучить, то найдёте решение
1) теоретически можно отредактировать файлы openssl https://github.com/oVirt/ovirt-engine/blob/master/packaging/...
на практике не проверял
2) сертификаты web-интерфейса oVirt Engine можно перевести на Let's Encrypt https://habr.com/ru/post/424127/, https://www.ovirt.org/documentation/administration_guide/#Re...
для обмена между engine и хостами виртуализации используются самоподписные сертификаты, созданные на engine.
По-умолчанию CA находится на ваших серверах, под вашим управлением. Переводить их в зависимость от внешних служб, для меня - сомнительная идея.
3) потеря производительности при виртуализации будет заметна при интенсивном использовании CPU и памяти (СУБД, задачи САПР) - для таких задач лучше использовать физические сервера. Виртуализацию лучше использовать для мало или средне нагруженных задач - появится возможность миграции между хостами, динамически менять объём ОЗУ и кол-во процессоров ВМ если не будет хватать ресурсов для задачи. На моей практике производительность больше упирается в ограничения ввода/вывода дисковой системы - когда несколько ВМ совместно используют хранилище.