потому что просто и универсально. И вообще юниксвей :)
Получая ответы от плагина mc "видит" архив или что-то еще как часть ФС и работает с ней как с ФС. Т.е. если мы хотим скопировать файлы, то mc получает список файлов и копирует их по одному.

Можно было бы запускать плагины как "демоны", тогда они бы могли хранить состояние и хотя бы не открывать один и тот же архив сотни раз, но можно получить осиротевшие (orphan) процессы.
Можно было бы собирать плагины вместе с mc, но это лишние зависимости, которые не всегда нужны. И будет нельзя писать плагины на баше.
Ну и есть вероятность, что так сложилось и для переделки нужны люди, а там даже xattrs при простом копировании не учитываются.