Даже невооружённым глазом видно, что почти все элементы интерфейса - это элементы второй версии, которые сильно отличаются от нативных в штатном gtk3. Почти каждый элемент третьей версии отличается от второй в лучшую сторону, если внимательно присмотреться, но разработчики не стали использовать эти преимущества, просто благодаря совместимости большинства элементов со старой версией и минимуме усилий со за стороны разрабов удалось собрать проект в gtk3, который по сути таковым не является. Даже декор окна оставили прежним, а не как у нативных gtk3-приложений.
Libreoffice тоже поддерживает gtk3 с помощью костылей, нет им ни конца ни края, но это никакой не gtk3-натив.