Что то я сомневаюсь что open(), getdents(), fstat(), fstatat() могут не блокируемо выполнятся на всяких smbfs, nfs, fusefs.ssh.
У меня 1-2 юзкейсов когда я вижу тормоза в thunar и их можно списать на это.
Завтра на работе как раз и сравню до и после добавления потока.

Насчёт statfs() - да, хорошой способ узнать что за fs там где надо мониторить.
Там же есть флаг MNT_LOCAL, который у меня сработал адекватно для всего, кроме fusefs.ssh (curl и прочие точно не локальные fusefs не юзаю, думаю там тоже самое).

Идея мониторить каждый отдельный файл и папку мне кажется очень плохой даже если бы в системе был O_EVTONLY: куча сисколов, куча дескрипторов - если в папке куча файлов то получится просто ад.

Наверное сделаю пока так: если фс локальная и там меньше 1к файлов то по таймеру раз в 5 сек проверять что поменялось, если от туда не было евентов обычным способом.
Если n больше 1000, то каждые 5 + (n/1000) секунд.
Хочу отдельный таймер на каждый мониторящийся объект, юзерам желательно будет подкрутить kern.kq_calloutmax.