>> 2. Отсутствие предсказуемой настройки правильной плотности пикселей, в том числе автоматически
>> и вручную.
> echo "Xft.dpi: 81" >> ~/.Xresources

Желательно бы упомянуть  до кучи "xrdb -merge ~/.Xresources" (хотя бы для тех, кто нагуглит ответ).

По теме:
Гнoмосеки cами, активно создают проблемы:
https://bugzilla.gnome.org/show_bug.cgi?id=757142
В 3.17 с какого-то перепугу решили, что если нет Xft.dpi, то нафиг не надо даже пытаться считать dpi с помощью иксов (DisplayHeight * 25.4 / DisplayHeightMM) и лучше сразу пользоваться  захардкоженой константой (dpi_double = 96).
> Status:     RESOLVED WONTFIX
> Perhaps I didn't make myself clear, so I will try again: the main issue is that completely autoconfigured (_no_ config files touched) HiDPI setups will no longer work "out of the box",
> because the information provided by the X server gets ignored by GTK+.

Причем,  ответы гнумовца (по совместительству "исправителя" кода) довольно "специфичны" -- на опеннете/лоре я бы решил, что он троллит, но для оф. отвечающего в багтрекере такое вроде бы немного невместно.
В общем, похоже со времен "великой чистки и выбрасывания ненужного" 2011-2013 ничего особо не изменилось.