Это — инструменты для решения одной задачи, отдачи веб-контента. В 99% случаев индеец заменяется на nginx с полпинка и серверу становится гораздо легче, а вот в 1% случаев наталкиваемся на диковинную самопИсь, в которой половина функций делается через htaccess и там фиг так просто перенесешь. За последние несколько лет я натолкнулся дважды на чудеса которые не переносятся нормально на nginx+что-то(php-fpm и ко), в одном случае автор самописи сгинул где-то в недрах истории и все работает как есть, пришлось просто ставить nginx в качестве фронт-энда, во втором автор занимается движком и сказал, что готовит следующую версию без заморочек с htaccess, а нынешняя версия пусть работает, как есть, все равно ей жить год-полтора, не больше.