>Изменил пароль для пользователя munin на munin, перезагрузил сервак, всё заработало. Не
>знаю, так и не понял, где была ошибка

Суть в том, что скрипты плагинов не понимают эти самые env-переменные. Поэтому используют логин/пароль по умолчанию munin/munin. Сам столкнулся с этим, мне пришлось еще и порт менять. Решилось только правкой плагинов.