>500 ошибку выдавал из-за .htaccess файла. Нашел, что nginx htacces не поддерживает.
>Убрал. Теперь, с этим же конфигом выдает ошибку:
>404 Not Found (все пути проверил, все правильно).
>Видимо, ошибка части конфига location /phpmyadmin/.
>Прошу помощи.

в location:

index  index.php;