>[оверквотинг удален]
>
>       cd db
>       ./installdb
>
>4.  Make sure the database name, prefix, and username/password you just
>created
>    and setup match the variable specified in the
>NDO2DB config file (see below).
>
>не могу понять как это будит выглядить правильно в командах!

1. Создать БД
# mysql --user=root -p
mysql>CREATE DATABASE nagios;
mysql>use mysql;
mysql>INSERT INTO user (host,user,password) VALUES ('localhost','nagios_user',password('nagios_user_pass');
mysql>quit // а может и не надо. но на всякий случай =)
# mysqladmin --user=root -p reload

2.
# mysql --user=root -p
mysql>GRANT SELECT,INSERT,UPDATE,DELETE on nagios.* TO nagios_user@localhost WITH GRANT OPTION;
mysql>quit
# mysqladmin --user=root -p reload

3.
# cd db
# ./installdb

4. Убедиться, что все хорошо

Дальше хуже будет. Такое надо знать.