В Debian в init.d лежит скелетон для своих скриптов. Там все по уму сделано в идеологии Debian. Выбери номер для своего скрипта, типа S65 (или как там... я давно линух несмотрел). Сделай по образу и подобию, подправь скелетончик и вперед. Будет все стройно и красиво. Я так делал включение num-lock на всех консолях после загрузки :))