>В Mysql создал пользователя со всеми привилегиями, в PHPmyadmin создал базу,

Пользователь seftp существует? Если да, он может коннектится локально(я имею ввиду права)?
Под какой учетной записью движок создавал БД? Для него установлен пароль?

>Warning: mysql_connect() [function.mysql-connect]: Access denied for user 'seftp'@'localhost' (using password: YES) in
>/usr/local/www/apache22/data/seftp/include/class_database.php on line 67

Значение имеет только это сообщение. Все остальное это прчина неудачной установки соединения

Скорее всего дело не в php.ini.