>>> Установил FreeBSD 7.1, при вводе startx запускаются окна, все нормально работает,
>>>теперь вопрос где хранятся конфигурационные файлы, хотелось бы разрешение экран подправить...
>>>
>>
>>/usr/local/etc/X11/xorg.conf
>
>файла нету

1. внимательно прочитать man xorgconf;
2. создать с помощью утилиты xorgconf файл конфигурации xorg.conf;
3. скопировать полученный файл в /etc/X11
4. не забывать делать резервные копии работающего xorg.conf перед каждым изменением;

Удачи!