Это вы ещё простыни правил в файлах .htaccess для Apache не видели. Некоторые веб-приложения раньше только под Apache затачивались и носили с собой километровые файлы .htaccess. Запустить их на чём-либо кроме Apache было проблематично.С nginx попроще, но тоже не идеал. И я считаю, что виноваты в этом по-прежнему веб-приложения. Если это CGI-приложение, то у него должен быть один файл, отвечающий за обработку всех запросов с человекочитаемыми URL и отдельный каталог со статическими файлами. Если бы все разработчики веб-приложений соблюдали такое правило, то никаких сложных правил в nginx было бы не нужно. Достаточно было бы парочки секций настроек для одного приложения: location /web-applicatin/ { } и location /web-application/static/ { }