> Куда копать, ума не приложу. Спасайте!

IDMAP

Почитай теорию - http://www.samba.org/samba/docs/man/Samba-HOWTO-Collection/i...

Потом посмотри, есть ли разница в idmap backend между smb.conf на разных серверах. Почитай логи - может она тебе там прямо говорит, какого ей не хватает.

С AD может оказаться дебильная причина вроде слишком большой разницы во времени. Синхронизируй по винде.