Нет, на самом деле я лишь чуть-чуть тупил.

xvid_encraw в исходниках озаглавлена как "test application" и лежит в каталоге "examples"[1], стоит ли её расценивать как лучший консольный интерфейс, сравнимый с гуями? Так-то возможен и полуконсольный вариант с VfW-кодеком, запускаемым через avs2avi или .jobs-файл VirtualDub'ов. А ещё можно забить на Xvid и присмотреться к фразе из вики: "последняя версия ASP кодека ... DivX 6.9.2".

Слова в help'е, что она принимает поток из stdin - это не документация, а археологический артефакт, предположительно означающий, что она в 2002 году съедала вывод конкретно из mpeg2dec. Но она принимает avisynth-файл (хотя 64-битной сборки под 64-битный ависинт из коробки нет), это очень хорошо, через скрипт можно скормить любой исходник и фильтры ависинта дают всё нужное. stdin ей пытались чинить, но только в неофициальных патчах, форках разной степени сохранности на 2024-й год, на форумах[2][3][4].

[1] http://websvn.xvid.org/cvs/viewvc.cgi/trunk/xvidcore/example...
[2] https://forum.doom9.org/showthread.php?t=181894
[3] https://forum.videohelp.com/threads/399070-Xvid-1-3-5-CLI-is...
[4] https://forum.videohelp.com/threads/386228-Xvid-1-3-5-(CLI)#post2597811