>> Если так настроить, то можно не выходя из одного браузера можно ходить по всему Интернету...
> Мне кажется, или это очень опасная в смысле деанонимизации пользователя ТОР настройка?
> Когда с одного и того же сайта часть ссылок откроется напрямую,
> а другая - через ТОР?

и чего плохого произойдёт  если с одного и того же сайта ссылки на другие  сайты будут открыты с разных айпишников если у меня referrer не передаёт имя сайта с которого я пришёл? Если бы передавался, то может и плохо.
Если реферрера нет, то сайты на которых я перешёл никак не отличат таких пользователей.
Другое дело есть цифровой отпечаток браузера( где куча параметров используется, то тут вариант не использовать javascript и flash, тогда это напорядок усложнит идентификацию пользователя со стороны сайтов.
Пройдитесь по этим ссылкам,чтобы понять насколько ваш браузер не уникален и позволяет ли за собой следить:
https://panopticlick.eff.org/
http://ip-check.info/?lang=en
https://amiunique.org/
https://ipleak.net/
Я думаю у  абсолютного большинства браузер можно однозначно идентифицировать! Ну кроме может использующих Тор-Браузер последней версии... Всех остальных можно  однозначно идентифиицровать.
Логичнее  с точки зрения анонимности на сегодняшний день  использовать тот же tor browser, а в нём в исключениях для прокси-socks5 сервера добавить адреса где пользователя можно  и так однозначно идентифировать другими способами(например, соцсети с привзякой к  сотововму телефону, в которых в свою очередь стоят сим карты при покупке которых требуют паспорт предъявить, личные кабинеты Ростелекома, налоговой, госуслуг и прочая...)
То есть везде ходить торбраузером, кроме определённых сайтов, но и там лучше использовать тор, так как его настройки  хотя бы пропустили через  нормальные руки  и он под пристальным вниманием тысяч людей, которым важна информационная безопасность!То есть везде ходить по Интернету торбраузером, кроме определённых сайтов, на которых тоже заходить этим же браузером, только не через тор сеть. Хотя, если сервис позволяет пользователю зайти через тор, то можно и через тор,  если там никакие критические данные не передаются. Например, усмановская mail.ru после вхождения пользователя через тор сеть в их почтовый сервис считает, что ящик вскрыт и запускает автоматически процедуру восстановления пароля с указанием сотового телефона.