Я бы сказал, что вы не совсем правы.
В отчёте выявляются реальные проблемы внедрения linux. Выводы делаются неверные, потому что видимо цель -- это вернуть контроль MS.

А проблемы в общем-то стандартные:
-- обучение персонала, который одну кнопку жал в одном интерфейсе по бумажке, а в другом интерфейсе теперь не может разобраться. Да и не хочет, потому что везде "нормальная винда", а тут админы впаривают чушь какую-то. Если предоставить таким юзерам выбор между виндой и линукс, для них решение будет очевидно -- юзать винду и "ничего я изучать не хочу -- верните как было всегда".
-- необходимость поддерживать актуальный образ системы, допиленный под нужды предприятия, а также всякие конфиги -- тоже требует обученного персонала и денег. И имеет смысл сравнить, что в конкретной ситуации будет дешевле для предприятия: поддерживать винду или линукс.
-- если документ в другой организации сверстали обезьяны, то форматирование уедет в каком-нибудь LibreOffice. И, да, это не проблема обезьян. Это проблема админа, от которого требуют открытие любых офисных файлов в том виде, в котором они открываются в MS Office. Кроме того, нужно обеспечить, чтобы тем, у кого MS Office, уходили только те файлы, которые они смогут открыть. И это происходит, потому что предприятие должно выполнять свои функции и контактировать с внешним миром, а что там на компах стоит никого не волнует.
-- Например, некоторые МФУ HP печатают под linux тупо медленнее (делают паузы между страницами по 2-5 секунд) на старых версиях hplip (у них образ на 12.04). Иногда виснет очередь печати наглухо. Заменить их полностью нереально -- выйдет дорого. Под виндой у них проблем не было. Конечно, нужно обновить сборку, но за это тоже надо платить.