> сделайте squid -k reconfigure в cache.log поидее должно прописаться какой конфиг используется,
> внимательно смотрим его, так же смотрим access.log на предмет разрешения того
> что должно было быть заблокировано, а то может оно мимо прокси
> шло 2013/05/31 11:18:42| Reconfiguring Squid Cache (version 2.7.STABLE6)...
2013/05/31 11:18:42| FD 12 Closing HTTP connection
2013/05/31 11:18:42| FD 13 Closing HTTP connection
2013/05/31 11:18:42| FD 14 Closing ICP connection
2013/05/31 11:18:42| logfileClose: closing log /usr/local/squid/var/logs/access.log
2013/05/31 11:18:42| Including Configuration File: /usr/local/squid/etc/squid.conf.deny (depth 0)
2013/05/31 11:18:42| Cache dir '/usr/local/squid/cache' size remains unchanged at 4194304 KB
2013/05/31 11:18:42| Initialising SSL.
2013/05/31 11:18:42| logfileOpen: opening log /usr/local/squid/var/logs/access.log
2013/05/31 11:18:42| Store logging disabled
2013/05/31 11:18:42| DNS Socket created at 0.0.0.0, port 49515, FD 7
2013/05/31 11:18:42| Adding domain ftr.ru from /etc/resolv.conf
2013/05/31 11:18:42| Adding nameserver 87.52.18.18 from /etc/resolv.conf
2013/05/31 11:18:42| Adding nameserver 192.168.0.20 from /etc/resolv.conf
2013/05/31 11:18:42| Accepting transparently proxied HTTP connections at 192.168.0.20, port 3128, FD 9.
2013/05/31 11:18:42| Accepting transparently proxied HTTP connections at 10.21.77.20, port 3128, FD 12.
2013/05/31 11:18:42| Accepting ICP messages at 0.0.0.0, port 3130, FD 13.
2013/05/31 11:18:42| WCCP Disabled.
2013/05/31 11:18:42| Pinger socket opened on FD 45
2013/05/31 11:18:42| Loaded Icons.
2013/05/31 11:18:42| Ready to serve requests.
2013/05/31 11:18:53| icmpRecv: recv: (61) Connection refused
2013/05/31 11:18:53| Closing Pinger socket on FD 45
После reconfigure сайты снова стали блокироваться.