> deb настолько костылен, что используется только в одном-единственном дистрибутиве Debian
> (а его деривативы унаследуют его, но не могут стать форками).

"Костылен" звучит негативно, и на самом деле, скорее отражает субъективное мнение, в засимости от отношения. При том, что "заморочен", а возможно "излишне заморочен" или "переусложнён", скорее больше подходит к ситуации, и менее субективен.

> rpm  — это стандарт LSB, используемый в разных дистрибутивах,

При том, что этот "стандарт", по факту, настолько стандартен, что у каждого это свой "стандарт", мало совместимый с другим подобным "стандартом", такие дела.
>  независимых друг от друга.

В том и дело, настолько независимых, насколько несовместимых, по факту, мы имеем только одинаковые три буквы в расширении, тогда как пакеты у каждого rpm-дистра свои, причём в некоторых даже структурно, привет Альтлинуксам!

Но, несмотря на всё это, лично я, ничего плохого не вижу в текущем положении вещей, если не ожидать "стандартов" от теоретического эфимерного "стандарта", существующего в вакууме, а принять таки различия разных систем, каждая из них по-своему занимательна и интересна.

Мне, например, наоборот, очень нравится связка apt-rpm, и слава богу, что оно такое, альтовские пакеты также не смущают форматом.
Последний аспект это такая мелочь, на фоне общей недурной работы дистрибутива, что придираться к подобному, на ровном месте, это уже из разряда загонов про перламутровые пуговицы.

Я действительно очень рад связке apt+rpm, потому что, в остальном мире rpm, менеджеры просто мрак, ужас и боль, до сих пор.
Ну, разве что zypper ещё луч света, но это уже другая история.
На мой взгляд, команда Альт с выбором apt не прогадала, лучше может быть что-то более совершенное и своё, другое дело, насколько это рационально, оправданно и нужно ли городить новые велосипеды, чисто потому что NiH?! Это другой вопрос, меня и так вполне устраивает.