The OpenNET Project / Index page

[ новости /+++ | форум | wiki | теги | ]

форумы  помощь  поиск  регистрация  вход/выход  слежка  RSS
"Выпуск биоинформационной программы UGENE 1.25.0"
Вариант для распечатки  
Пред. тема | След. тема 
Форум Разговоры, обсуждение новостей
Изначальное сообщение [ Отслеживать ]

"Выпуск биоинформационной программы UGENE 1.25.0"  +/
Сообщение от opennews (??) on 13-Окт-16, 11:09 
Состоялся (http://ugene.net/ru/news.html) релиз UGENE 1.25 (http://ugene.net/ru/), пакета для работы молекулярного биолога, предоставляющий  инструменты для множественного выравнивания нуклеотидных и аминокислотных последовательностей,  филогенетического анализа, редактирования и аннотирования нуклеотидных и белковых последовательностей,  поддержания биоинформационной базы данных, визуализации,  поиска геномных вариаций, работы с хроматограммами и многого другого (http://ugene.net/ru/key_features.html). Исходные тексты UGENE распространяются (http://ugene.unipro.ru/ru/download.html) под лицензией GPLv2, сборки доступны для Windows, macOS и Linux.

В новом выпуске для NGS добавлена возможность фильтрации прочтений, не имеющих пары, при картировании парных прочтений на референсную последовательность (с помощью BWA, Bowtie2 и т.п.).  в В диалогах настройки схем анализа сырых данных NGS добавлен расширенный набор параметров для обрезания адаптерных последовательностей (5′-адаптеры, 3′-адаптеры, 5′- и 3′-адаптеры). В Assembly Browser выполнена оптимизация вычисления покрытия. Продолжается работа над новой функцией UGENE для удобной визуализации и анализа данных секвенирования по Сэнгеру.

URL: http://ugene.net/ru/news.html
Новость: https://www.opennet.ru/opennews/art.shtml?num=45314

Ответить | Правка | Cообщить модератору

Оглавление

Сообщения по теме [Сортировка по времени | RSS]


1. "Выпуск биоинформационной программы UGENE 1.25.0"  +1 +/
Сообщение от Аноним (??) on 13-Окт-16, 11:09 
10 молекулярных биологов из 10
Ответить | Правка | ^ к родителю #0 | Наверх | Cообщить модератору

2. "Выпуск биоинформационной программы UGENE 1.25.0"  –9 +/
Сообщение от Аноним (??) on 13-Окт-16, 11:10 
Кто-то юзает вообще эту программу?
Ответить | Правка | ^ к родителю #0 | Наверх | Cообщить модератору

5. "Выпуск биоинформационной программы UGENE 1.25.0"  +/
Сообщение от Аноним (??) on 13-Окт-16, 16:44 
Зачем эта новость на рускоязычном ресурсе? Разве в России есть молекулярные биологи?
Ответить | Правка | ^ к родителю #0 | Наверх | Cообщить модератору

6. "Выпуск биоинформационной программы UGENE 1.25.0"  –1 +/
Сообщение от skybon (ok) on 13-Окт-16, 17:50 
Тоньше надо, сударь.
Ответить | Правка | ^ к родителю #5 | Наверх | Cообщить модератору

8. "Выпуск биоинформационной программы UGENE 1.25.0"  +/
Сообщение от dsfdsgfsdgsdf on 13-Окт-16, 19:15 
Ноосферологи точно имеются.
Ответить | Правка | ^ к родителю #5 | Наверх | Cообщить модератору

9. "Выпуск биоинформационной программы UGENE 1.25.0"  +/
Сообщение от Аноним (??) on 13-Окт-16, 20:02 
Лично знаю пару аспирантов. Кстати, по их мнению нормальный софт для проведения исследований в области микробиологии есть только в *nix. Используют ли они сабж - не в курсе...
Ответить | Правка | ^ к родителю #5 | Наверх | Cообщить модератору

11. "Выпуск биоинформационной программы UGENE 1.25.0"  –1 +/
Сообщение от Аноним (??) on 13-Окт-16, 23:44 
Институт Биоинформатики? Не, не слышал. Куда тебе.
Ответить | Правка | ^ к родителю #5 | Наверх | Cообщить модератору

12. "Выпуск биоинформационной программы UGENE 1.25.0"  +/
Сообщение от Аноним (??) on 14-Окт-16, 12:37 
Наличие института не говорит о наличии спецов.
Ответить | Правка | ^ к родителю #11 | Наверх | Cообщить модератору

14. "Выпуск биоинформационной программы UGENE 1.25.0"  +/
Сообщение от Алексей Морозов (ok) on 16-Окт-16, 00:47 
В некоторых областях (те же бактериофаги) — так бСССР и впереди планеты всей, есичо, до сих пор. Во всяком случае, этим летом у супруги на конференции в Ливерпуле граждане из США и З.Европы так с удивлением и спрашивали: "Что, прямо можно пойти в аптеку, и купить бактериофажный коктейль?!". У них-то в свое время посчитали, что антибиотики — решение всех проблем, и альтернативные подходы покоцали.
Тема сейчас очень горячая, в связи с широким распространением резистентности бактерий к антибиотикам.
Ответить | Правка | ^ к родителю #12 | Наверх | Cообщить модератору

10. "Выпуск биоинформационной программы UGENE 1.25.0"  +1 +/
Сообщение от Anon43210 on 13-Окт-16, 20:21 
Вдруг кто-то заинтересуется, прочитав эту новость, окунётся в эту область. И появится такой спец :)
Ответить | Правка | ^ к родителю #0 | Наверх | Cообщить модератору

13. "Выпуск биоинформационной программы UGENE 1.25.0"  +/
Сообщение от Аноним (??) on 14-Окт-16, 12:49 
> окунётся в эту область. И появится такой спец

ИМХО, туда уже проблематично залезть. Лет 10 назад еще прокатывали случаи, когда строитель или программист занимались фолдингом белков или секвенированием ДНК. Сейчас готовят нормальных специалистов, которые шарят в биологии/химии, которым можно доверить проведение экспериментов на живых организмах и которые в состоянии написать скрипт на питоне для обработки результатов.

Т.е. люди со стороны уже типа не очень нужны, а новые специальности вряд ли страдают недобором...

Ответить | Правка | ^ к родителю #10 | Наверх | Cообщить модератору

15. "Выпуск биоинформационной программы UGENE 1.25.0"  +/
Сообщение от Алексей Морозов (ok) on 16-Окт-16, 00:49 
> ИМХО, туда уже проблематично залезть.

Биоинформатиков готовят — только шум стоит. Шум от публикаций и последующего обсуждения.


Ответить | Правка | ^ к родителю #13 | Наверх | Cообщить модератору

16. "Выпуск биоинформационной программы UGENE 1.25.0"  +/
Сообщение от Алексей Морозов (ok) on 16-Окт-16, 00:52 
> Биоинформатиков готовят — только шум стоит. Шум от публикаций и последующего обсуждения.

... правда, опять же со слов супруги, UGENE не слишком удобен/привычен для её собственных задач. Я ей все предлагаю как-нибудь выйти из института, пройти 200 метров до здания, где этот UGENE пишут и высказать все свои претензии лично :)


Ответить | Правка | ^ к родителю #15 | Наверх | Cообщить модератору

17. "Выпуск биоинформационной программы UGENE 1.25.0"  +/
Сообщение от Юлия email(??) on 13-Фев-17, 09:31 
Приходите! Пишите! Мы будем очень рады отзывам и любым предложениям и пожеланиям.

Писать можно вот сюда: ugene@unipro.ru
Благодаря Вашим отзывам мы становимся лучше.

Спасибо!

Ответить | Правка | ^ к родителю #16 | Наверх | Cообщить модератору

Архив | Удалить

Рекомендовать для помещения в FAQ | Индекс форумов | Темы | Пред. тема | След. тема




Спонсоры:
Слёрм
Inferno Solutions
Hosting by Ihor
Хостинг:

Закладки на сайте
Проследить за страницей
Created 1996-2019 by Maxim Chirkov
Добавить, Поддержать, Вебмастеру