> - где там про использование "git add"? Наоборот, такая же хрень
> с добавочными командами, что и с git-annex, причём названия команд целенаправленно
> выбраны наркоманскими ("git track" вместо "git add" etc.)

Эти добавочные команды только для настройки типов выносимых в отдельный репозиторий файлов и отслеживания его содержимого. Работа производится как с обычным репозиторием через "git add", "git push" и т.п.

Вот примеры из документации к git-lfs:

Pushing commits

Once setup, you're ready to push some commits:

$ git add my.zip
$ git commit -m "add zip"

You can confirm that Git LFS is managing your zip file:

$ git lfs ls-files
my.zip

Once you've made your commits, push your files to the Git remote:

$ git push origin master
Sending my.zip
12.58 MB / 12.58 MB  100.00 %
Counting objects: 2, done.
Delta compression using up to 8 threads.
Compressing objects: 100% (5/5), done.
Writing objects: 100% (5/5), 548 bytes | 0 bytes/s, done.
Total 5 (delta 1), reused 0 (delta 0)
To https://github.com/github/git-lfs-test
   67fcf6a..47b2002  master -> master