https://slinkov.ru/openforum/vsluhforumID3/109384.html Состоялся (http://ugene.net/ru/news.html) релиз UGENE 1.25 (http://ugene.net/ru/), пакета для работы молекулярного биолога, предоставляющий инструменты для множественного выравнивания нуклеотидных и аминокислотных последовательностей, филогенетического анализа, редактирования и аннотирования нуклеотидных и белковых последовательностей, поддержания биоинформационной базы данных, визуализации, поиска геномных вариаций, работы с хроматограммами и многого другого (http://ugene.net/ru/key_features.html). Исходные тексты UGENE распространяются (http://ugene.unipro.ru/ru/download.html) под лицензией GPLv2, сборки доступны для Windows, macOS и Linux.<br><br><br><br><br><br>В новом выпуске для NGS добавлена возможность фильтрации прочтений, не имеющих пары, при картировании парных прочтений на референсную последовательность (с помощью BWA, Bowtie2 и т.п.). в В диалогах настройки схем анализа сырых данных NGS добавлен расширенный набор параметров для обрезания адаптерных последовательностей (5&#8242;-адаптеры, 3&#8242;-адаптеры https://slinkov.ru/openforum/vsluhforumID3/109384.html#17 Mon, 13 Feb 2017 06:31:11 GMT Приходите! Пишите! Мы будем очень рады отзывам и любым предложениям и пожеланиям.<br><br>Писать можно вот сюда: ugene@unipro.ru<br>Благодаря Вашим отзывам мы становимся лучше.<br><br>Спасибо!<br> https://slinkov.ru/openforum/vsluhforumID3/109384.html#16 Sat, 15 Oct 2016 21:52:27 GMT &gt; Биоинформатиков готовят &#8212; только шум стоит. Шум от публикаций и последующего обсуждения. <br><br>... правда, опять же со слов супруги, UGENE не слишком удобен/привычен для её собственных задач. Я ей все предлагаю как-нибудь выйти из института, пройти 200 метров до здания, где этот UGENE пишут и высказать все свои претензии лично :)<br> <br><br><br> https://slinkov.ru/openforum/vsluhforumID3/109384.html#15 Sat, 15 Oct 2016 21:49:26 GMT &gt; ИМХО, туда уже проблематично залезть.<br><br>Биоинформатиков готовят &#8212; только шум стоит. Шум от публикаций и последующего обсуждения.<br><br><br> https://slinkov.ru/openforum/vsluhforumID3/109384.html#14 Sat, 15 Oct 2016 21:47:23 GMT В некоторых областях (те же бактериофаги) &#8212; так бСССР и впереди планеты всей, есичо, до сих пор. Во всяком случае, этим летом у супруги на конференции в Ливерпуле граждане из США и З.Европы так с удивлением и спрашивали: "Что, прямо можно пойти в аптеку, и купить бактериофажный коктейль?!". У них-то в свое время посчитали, что антибиотики &#8212; решение всех проблем, и альтернативные подходы покоцали.<br>Тема сейчас очень горячая, в связи с широким распространением резистентности бактерий к антибиотикам.<br> https://slinkov.ru/openforum/vsluhforumID3/109384.html#13 Fri, 14 Oct 2016 09:49:52 GMT &gt; окунётся в эту область. И появится такой спец<br><br>ИМХО, туда уже проблематично залезть. Лет 10 назад еще прокатывали случаи, когда строитель или программист занимались фолдингом белков или секвенированием ДНК. Сейчас готовят нормальных специалистов, которые шарят в биологии/химии, которым можно доверить проведение экспериментов на живых организмах и которые в состоянии написать скрипт на питоне для обработки результатов.<br><br>Т.е. люди со стороны уже типа не очень нужны, а новые специальности вряд ли страдают недобором...<br> https://slinkov.ru/openforum/vsluhforumID3/109384.html#12 Fri, 14 Oct 2016 09:37:26 GMT Наличие института не говорит о наличии спецов.<br> https://slinkov.ru/openforum/vsluhforumID3/109384.html#11 Thu, 13 Oct 2016 20:44:55 GMT Институт Биоинформатики? Не, не слышал. Куда тебе.<br> https://slinkov.ru/openforum/vsluhforumID3/109384.html#10 Thu, 13 Oct 2016 17:21:24 GMT Вдруг кто-то заинтересуется, прочитав эту новость, окунётся в эту область. И появится такой спец :)<br> https://slinkov.ru/openforum/vsluhforumID3/109384.html#9 Thu, 13 Oct 2016 17:02:46 GMT Лично знаю пару аспирантов. Кстати, по их мнению нормальный софт для проведения исследований в области микробиологии есть только в *nix. Используют ли они сабж - не в курсе...<br>