Временное выключение TouchPad:

   synclient TouchpadOff=1

Временное включение:

   synclient TouchpadOff=0

Вообще, у X.Org-драйвера synaptic много интересных опций, посмотреть которые
можно через "man synaptics".

Для постоянного выключения через HAL (в старых X11 можно было просто убрать из
файла конфигурации), надо открыть файл, скажем /etc/hal/fdi/policy/touchpad.fdi
и поместить в него:

   <match key="info.product" string="SynPS/2 Synaptics TouchPad">
    <merge key="input.x11_options.TouchpadOff" type="string">1</merge>
   </match>

вместо "SynPS/2 Synaptics TouchPad" возможно надо будет указать другую строку,
подробности стоит смотреть в "xinput list":

   xinput list| grep -i touch

Еще есть syndaemon или в настройках gnome временное отключение TouchPad.