Устанавливаем пакет apt-build:

   apt-get install apt-build  

Настраиваем его командой  dpkg-reconfigure apt-build, тут нам надо будет ответить
на вопросы об уровне оптимизации и об архитектуре вашего процессора. 

Далее надо убедится, что у нас раскоментированы репозитарии исходников в /etc/apt/sources.list 
(эти строки начинаются с deb-src). Обновляем список репозитариев apt-get update.  

 Ну и всё, дальше вместо apt-get используем apt-build. Ключи и опции apt-build такие же как и у apt-get:  

   apt-build update - обновление списка репозитариев и софта в них,
   apt-build upgrade - апгрейд установленных пакетов,
   apt-build install  - устанавливаем программу,
   apt-build world - а это перекомпилит всю вашу систему! Тут всё на ваш страх и риск!

При первом запуске apt-build вы увидите следующее сообщение об ошибке: 

   -----Rebuilding the world!-----
   -----Building package list-----
   Please read README.Debian first. 

Просто apt-build не знает какой софт у вас установлен. 
Для того чтобы побороть эту ошибку достаточно ввести команду:  

   dpkg --get-selections | awk '{if ($2 == "install") print $1}'> /etc/apt/apt-build.list 

Ну а дальше работаем с apt-build как с apt-get. 
Рекомендую вставлять ключи  --yes and --force-yes для  того чтобы весь процесс
проходил на автомате.