Одним из наиболее часто используемых приложений в этой области является Blast. Для Blast есть патч, который заставляет его работать более гладко с openMosix, но это – не единственная альтернатива.

Прежде всего, у этого патча и у других версий Blast есть некоторые известные проблемы: Blast имеет иногда тенденцию к ошибке сегментации (segfault). Это в основном случается с преформатированными базами, которые вы скачиваете из Интернет. Если вы выполните formatdb на исходной базе, эти ошибки склонны исчезать.

Вслед за патчем Blast для openMosix многие люди применяют MPIBlast. Принимая во внимание факт, что openMosix имеет тенденцию ускорять MPI, добавление openMosix к этой конфигурации должно придать вашим деньгам больше силы, тем не менее, мы должны будем произвести некоторые дополнительные исследования, чтобы получить возможность подтвердить это.