>  при переходе по ссылкам страницы грузились бы быстрее, потому что с сервера вместо целого куска html прилетал бы маленький json

Для ситуаций, где выгода от загрузки маленького json существенна, проблемой становится дождаться, пока загрузится первая страница, со всем тем фаршем, который нужен для такого способа загрузки контента. Особенно, когда кодер прочёл пятиминутную хаутушку, уяк-уяк-и-в-продакшон, а потом юзер получает для каждой страницы десятки мелких .js и .css - или потому что до минификации кодер не дочитал (потому что за спиной стоял тимлид с кнутом и требовал быстрей-быстрей выкатить сайт), или она вообще не предусмотрена в веб-фреймворке (потому что за спиной стоял тимлид с кнутом и требовал быстрей-быстрей выкатить релиз).