Вопрос риторический, конечно, но я всё равно отвечу:
1. Херовое продвижение. Пример: BeOS. Отличная во всех отношениях операционка, но её пытались продавать дуалбутом с Виндой, причём Винда загружалась по-умолчанию. Куча людей тупо никогда её не видела
2. Именитые конкуренты. Pebble: часы были неплохими, но за брендами вроде Apple или Samsung им было не угнаться
3. Легальные проблемы. (Free|Net|Open)BSD: Операционки были и остаются нормальными, но из-за исков AT&T по Unix в целом многие начали развивать Linux, чтобы избежать легальных проблем. Это не помогло, но когда на Linux начались нападки юристов, большинство верили, что шансов выиграть больше, чем у FreeBSD.
4. Наследие прошлого. Windows: сейчас это пристойная операционка, глюки которой довольно редки и начинается процесс интеграции POSIX-плюшек (например, уже есть аналог UNIX-сокетов). Но вспоминать её как эталон глючности будут ещё долго.
5. Субъективность оценки. systemd: какие бы не были у него достоинства, её будут считать отстоем по причине не UNIX-way, личности создателя, откровенному навязыванию и другими нетехническими вещами.
6. Неудобство/сложность. Ручная коробка передач: по всем параметрам надёжности, простоты исполнения, ремонтопригодности и цены она уделывает автомат. Но она активно вытесняется потому что автомат гораздо удобнее и проще в использовании.
7. Вытеснение новыми технологиями. ЭЛТ: к концу своего развития они были очень хороши: приличные диагонали(для того времени), хорошая частота развёртки, хорошая цветопередача. Когда LCD появлялись, они все их характеристики были говном, включая надёжность и цену. Время шло, техника развивалась, и где теперь ЭЛТ?

Может, ещё что-то, не знаю.
Docker -- это тот самый LCD-монитор. Он говно полное на данный момент, но он очень удобен для задач быстрой единообразной развёртки и борьбы с тоннами зависимостей. Ну серьёзно,
docker pull x && docker run x
гораздо быстрее весёлой возни с тоннами конфигов, отличающихся от системы к системе, от версии к версии и железа к железу. Технические недостатки преодолеют, пользоваться станут почти все, но по старой памяти продолжат называть кучей кала.