не видимо я плохо объяснил, данные снимаются как надо, nagios -v отрабатывает на отлично. покажу следующую картину,
картина на узле
prol ~ # df -h /
Filesystem            Size  Used Avail Use% Mounted on
/dev/md0              9.2G  7.9G  932M  90% /
prol ~ # df /
Filesystem           1K-blocks      Used Available Use% Mounted on
/dev/md0               9621816   8179384    953660  90% /

картина на мониторинге
kvm520-sm nagios # check_snmp_storage -H prol -C gJilIogg -w 90% -c 95% -m / -r
OK : /: 85%used(7988MB/9396MB)  : < 90 %  | /=7987MB;8456;8926;0;9396
kvm520-sm nagios # check_snmp_storage -H prol -C gJilIogg -R 6% -w 90% -c 95% -m / -r
WARNING : /: 90%used(7988MB/8833MB)  : > 90 %  | /=7987MB;7949;8390;0;8832

-R 6% это чтобы подогнаться к ext3, для reiserfs - 5% , и этот -R нужно обязательно вводить чтобы получить значения которые соответствуют действительности, иначе получим немного обрезанные данные (без каких-то зарезервированных блоков для рута)
имхо это лишняя фича, и вводит в заблуждение новичков, когда они видят расхождение в значениях)))

и сейчас осваиваю нагиос, наталкиваюсь на такие фокусы почти через раз:)